一、发菌期管理接完菌种后的栽培袋要及时搬入培养室进行发菌管理，培养室要求通风、干燥、遮光。摆放栽培袋前要对空间消毒一次，室温控制在21℃～27℃，空间湿度控制在70％左右。在培养过程中，由于菌丝的新陈代谢，培养室的温度会逐渐升高，室内氧气被大量消耗，这时要特别注意通风换气，避免“烧菌”。培养40～50天，菌丝即可长满全袋。
二、出菇期管理一般采用单层直立排放式，当菇蕾出现后，原基形成珊瑚状，这时去掉棉花及套环，将塑料袋向外下翻3～5厘米，上盖报纸，并喷水保湿，以促使茶薪菇子实体形成。有条件的最好把菇蕾大小一致的移在一起，以便管理。随着菇体向上伸长，逐渐拉直袋口，直到收菇。由于茶薪菇具有趋光性和二氧化碳促进菌柄伸长的特性，拉直袋口，在袋内营造较高浓度二氧化碳的小环境，有利于提高茶薪菇的商品价值。收完第一潮菇后过一段时间开始出现第二潮菇，这时菇蕾不一定在顶面发生，可以在菇蕾发生处割袋，使生长的菇蕾能顺利生长。后期还可采用搔菌或采用倒头出菇的方法进行管理。由于茶薪菇容易产生连体菇，而且菇体大小也参差不齐，这时可适当疏蕾，及时割掉部分小菇蕾。
