穴盘育苗的特点是每一株幼苗都拥有独立的空间，水分养分互不竞争，幼苗的根系完整，移植后的成活率接近100%，移植后的生长发育快速整齐,商品率高。因此，穴盘育苗在花卉育苗上的应用是一种新的发展趋势。
花卉种子小、价格高是花卉生产中一个突出问题。因为种子小，往往造成幼苗阶段生长缓慢且娇嫩，苗期时间过长，成苗率低；种子价格高，导致成本高，影响生产的收益，给花卉企业带来损失和风险。采用穴盘育苗方式，可以大大提高花卉育苗的发芽率和整齐度，缩短培育时间，提高花卉的商品价格和商品率。尤其对使用小粒种子育苗的盆花和花坛苗来说，无疑是一次很重要的技术进步。
四个阶段
美国的戴维·柯瑞恩（Dav idkoranski）将穴盘育苗的生育期分为四个阶段。之所以将育苗划分为四个阶段是因为这四个阶段的生长状态与所需要的温度、湿度（相对湿度）、光照、肥料等环境和管理条件各有区别。这四个阶段的管理好不好，不仅对幼苗期的发育而且对花卉的形状、开花数量、生产周期都有很大影响。如瓜叶菊，如果温度在第二阶段超过28℃，则很容易造成胚轴过于伸长，极容易倒伏。而四季海棠如果第二、三阶段不能及时施肥的话，以后施肥也会造成生长迟缓一个多月。
第一阶段从播种到种子初生根（胚根）突出种皮为止，即所谓的“发芽”期。发芽期最主要的特征是需要较高的温度和湿度。较高的温度是相对于以后三个阶段来说的。种子发芽所需要的温度一般在21℃～28℃之间，大部分在24℃～25℃为最适温度，持续恒定的温度对种子来说可以促进种子对水分的吸收，解除休眠，激活生命活力。较高的湿度可以满足种子对水分的需要，首先，软化种皮，增加透性，为种胚的发育提供必需的氧气；其次作为种子生化反应的溶剂，促进其生物化学反应的完成，由一种新的生命形式替代潜在的生命状态。
第二阶段种子发芽以后，紧接着是下胚轴伸长，顶芽突破基质，上胚轴伸长，子叶展开，根系、茎干及子叶开始进入发育状态。这一阶段称为第二阶段。第二阶段的管理重点是下胚轴的矮化及促壮。如果下胚轴伸长过快，就会引起幼苗徒长。要想促壮及矮化幼苗的下胚轴，必须严格控制栽培环境的各个主导因子，如温度、湿度、光照等。幼苗子叶展开的下胚轴长度以0.5cm较为理想，1.0cm以上则有徒长的现象。下胚轴若太长，当真叶开始伸展时，随着真叶的叶面积增大及叶片数目的增多，其机械支撑力量不足，容易发生倒伏现象。当下胚轴太长而形成倒伏之后是无法恢复的，所以下胚轴的矮化及促壮是提高成苗率的关键。第三阶段主要是真叶的生长和发育。这一阶段的管理重点是水分和肥料。水分的管理重点在于维持生育期间的水分平衡，避免基质忽干忽湿，做到在适当的时候给予适量的水分。在人工浇水的条件下，要先观测基质的干湿程度和蒸发情况，确定浇水的时间和浇水量。在自动喷灌条件下，一天浇水三次，每次给水量约达到基质持水量的60%为宜。浇水时间分别为8点、11点及14～15点之间。16点之后若幼苗无萎蔫现象，则不必浇水。降低夜间湿度，减缓茎节的伸长，矮化幼苗是管理追求的目标。
进入第三阶段的幼苗要开始施肥。最始肥料的浓度为2500～3000倍（或100～150ppm）足够，当最初的两片真叶完全展开之后，肥料浓度增加到2000倍。肥料氮、磷、钾的比例选择氮含量较低的配方（N∶P∶K=15∶10∶30），以减少叶面积的快速生长，降低其蒸腾作用。营养过量，除了容易造成徒长弱苗之外，基质的电导率增加，根系的正常发育也会受到影响。
第四阶段幼苗生长到3～4片真叶时，也就到了第四阶段。此阶段的幼苗准备进行移植或出售。移植前要适当控水施肥，以不发生萎蔫和不影响其正常发育即可。
