辣椒出苗前，苗床温度保持在28℃～30℃，高于30℃要遮阳降温，低于16℃可加盖草苫保温。出苗后，白天温度保持在25℃～27℃，晚上温度保持在16℃～20℃。分苗前5～7天降温锻炼秧苗，白天温度保持在20℃～25℃，晚上温度保持在15℃～18℃。苗期一般不用浇水，如土壤干旱，可在上午喷灌。幼苗出齐至2片真叶时，可结合除草进行间苗，拔除细、弱、密、并生地苗，苗距保持在2～3厘米。
待幼苗长出3～4片真叶时，应及时分苗。分苗床应建在日光温室内，分苗畦要求与育苗床相同。分苗时株行距为10厘米×10厘米，每穴放单苗或双苗。放双苗时，两苗地间距为2厘米。分苗后立即浇水、覆土，并覆盖塑料薄膜保温。
分苗初期，白天温度保持在25℃～29℃，晚上温度保持在15℃～18℃。定植前5～7天降温以锻炼秧苗，白天温度保持在20℃～25℃，晚上温度保持在14℃～16℃。
定植前7～10天将苗床浇透水，待水渗下后，用长刀在秧苗地株、行间切块，入土深10厘米，使秧苗在土块中间。切块后不再浇水（如土壤过干，可覆细土），使土块变硬，以利定植时带土坨起苗。定植前，苗床要喷药预防治理病虫害。
