镰孢性基腐病
该病最初发生在球根基部，随后向上侵染至鳞茎。染病处与健康组织区别明显，染病部位组织变软，灰褐色，向内抽，有时被覆白色织状物，染病种球栽种后不能产花。在温室中如植株早期受侵染，则地上部分变软，叶片从叶尖处开始变黄，不久植株死亡；若后期染病，则生长停滞，花芽干枯，球根内部的花茎基部长期不发育，表皮褶皱。
病因此病由镰孢病菌引起，侵染途径一是通过孢子侵染，二是健康植株接触受病种球。该病菌可通过土壤传播，因此，在已消毒的土壤中种植有病种球十分危险。鸢尾、唐菖蒲、小苍兰均易受该病菌的危害。当土温在16℃左右时易发病，高温使病菌传播加快。
防治种植唐菖蒲、小苍兰时应交替轮作，或一年进行一次土壤处理，种植前还要进行球根处理。
灰霉病
植株生长受阻，叶鞘受湿腐影响，从地面部分起向上被覆着灰色的孢子网。结果，叶尖虽不黄，但植株仍倒伏。受病球根出现伤流现象，腐烂变褐，但无异味。除去表皮后，球根顶部可看到灰色织物，并伴有黑色菌丝块。根部和基盘不受侵染。除了受损叶或干叶外，叶片一般不受危害。在潮湿环境下，会在花朵上出现不规则斑点。
病因灰霉病由灰色葡萄孢属真菌引起，通常在潮湿环境下发病。被阳光灼伤的叶片遇霜害容易染病。此外，该病菌还能危害其他多种作物和植物。
防治避免叶片受损。新芽长于5厘米的球根不再栽种，尤其不能使用地膜。注意避免阳光灼伤。球根种植不要过密，在生长期内保持种植地无杂草。温室中相对湿度保持80％左右，必要时可加热降湿。上午浇水，保证植株夜晚干燥。叶面受损后，根据需要喷撒杀菌剂。
