胡萝卜根部的颜色由胡萝卜素和叶黄素控制，颜色的深浅因品种不同而不同。胡萝卜着色的适宜温度为16–21℃，当温度高于21℃时，胡萝卜素形成不良，所以夏播胡萝卜着色较迟。当温度高于16℃时，肉质根生长不良；当土壤透气性好，空气充足时，着色好。若在空气少，排水不良的地块种植胡萝卜，则颜色较差；土壤中的养分可影响到植株的同化作用，同化作用的好坏会影响到同化物质向根部运输的数量，所以土壤中的养分对胡萝卜的着色产生间接的作用；随着肉质根部逐渐膨大，肉质根着色不断加深，因此提前收获胡萝卜着色不良。其防治方法是：一要掌握好适宜的播期；二要在有条件的情况下，注意控制温度在16–21℃范围内；三要选择通风条件较好的砂土壤；四要施足底肥，在适宜时期收获。
造成胡萝卜肉质根曲根、短根、叉根等异形根的原因主要有以下几个方面：胡萝卜在土壤粘重、整地不良、耕层浅、新土坚实的土壤中生长，肉质根伸长受阻；种子贮藏时间过长，种子活力降低，造成胡萝卜植株生长势减弱；土壤中或施入的基肥中杂质多，如砖块或石块等，妨碍了肉质根的生长；使用未腐熟的有机肥和化肥直接接触根部而引起烧根；间苗时引起植株倒伏，间苗后不及时中耕覆土，易造成曲根；地下害虫咬伤主根先端，侧根膨大后分叉或畸形。
从植株形态辨别根异常的方法：肉质根正常的植株呈半直立状，叶片向周围均匀展开，呈同心圆状，而曲根的植株叶片向一侧展开，叶片扭曲。当植株形成了叉根，植株吸收养分和水分的面积增大，地上部生长发育旺盛，植株略呈开展状，并出现叶片扭曲。形成短粗分枝根的植株从肉质根膨大初期开始，靠近地面的根变粗，地上部呈展开状，这种异常现象主要在干燥、多湿、多肥的环境下发生。当气温低于16℃时，肉质根吸养分不良，根细长；当温度高于25℃时，易形成粗胖肉质根。在土壤干燥的情况下，肉质根膨大会受到抑制。一般土壤含水量以30％左右为宜。
防治方法：选择耕层深，土质疏松，排水良好，最好是前茬曾施过大量堆肥作基肥，有机质比较丰富的土壤种植胡萝卜，间苗后立即培土，选用新鲜种子，基肥要充分腐熟，全面铺施，与土壤充分混匀，基肥最好过筛，去掉其中杂质，防治地下害虫侵害。
