菜豆为自花授粉植物，异花授粉只有0.2%—l%，为保持优良品种的纯度，不同品种宜间隔100米以上。矮性种宜选留强壮无病植株中部所结荚果作种。蔓性种宜选留植株基部和中间部即在蔓1/3高度以下的荚果；植株上部的荚果，种子大都不充实，不宜选留。种株除留种荚外，其余嫩荚应摘除。菜豆的种子发育大致在开花后25—30天完成。当豆荚从青绿转为黄色，曲折不易折断时，为种用成熟，及时采收。
春播用种子，可用去年春季采种的或秋季采种的，而以去年秋季采种的较好。因为秋季留种，种子比较充实饱满，发芽率较高，出苗也整齐。种子的发芽率，一般可保持3年，但生产上多采用前一年采收的种子。
