近年来，随着复种指数的提高，辣椒疫病发病田块逐年增多，受害程度越来越严重。
该病在苗期，茎基部产生暗绿色腐烂，小苗倒伏，成株期叶片受害，病斑近圆形、暗绿色，没有明显边缘，环境湿热扩展很快，使整个叶片腐烂；茎和果实发病，形成暗绿色至暗褐色腐烂，发展很快，往往整个果实腐烂，腐烂处长1层薄薄白霉。该病的致病菌如真菌中鞭毛菌亚门疫霉属辣椒疫霉菌，以卵孢子和厚坦孢子在土壤里和病株残体上越冬，或随种子带菌。翌年环境条件适宜时，越冬的卵孢子和厚坦孢子萌发管侵入寄主，并在病株上产生孢子囊和游动孢子，孢子囊和游动孢子随气流、雨水和灌溉水传播，进行再侵染，以致使该病流行。据观察，高温、高湿、土壤积水，或干旱时大水漫灌，以及多年连茬地块，普遍发病，且危害严重。
防治辣椒疫病，除在选用抗病高产良种基础上，可采取以下措施：
1合理轮作前茬收获后及时清理田园，集中处理残枝落叶，采用与十字花科蔬菜或豆科作物轮作，或采用水旱轮作，以减少土壤病菌残留量。
2培育壮苗培育叶片肥厚，叶色浓绿，幼茎粗壮，根系发达的适龄壮苗，是防治辣椒疫病实现高产优质的关键。为此，必须确实做好种子和苗床的消毒工作，加强苗期管理。消毒方法为：
2.1种子消毒将种子用52摄氏度温水浸30分钟后移入冷水中冷却，捞出后拌少量草木灰后播种；或把种子在冷水中预浸10小时，再用1%硫酸铜浸5分钟，捞出后拌少量草木灰立即播种。
2.2苗床消毒每平方米苗床用8克40%乙磷铝或25%瑞毒霉可湿性粉剂，与15千克细土拌匀，播种时用1/3药土垫底，2/3药土盖种。
3合理密植适当密植可以提早封垄，这样，地表有枝叶覆盖遮荫，土壤温湿度变化小，植株长势好，抗病力增强。
4注意排水可采用深沟高畦整地，做到雨停畦干，晴天于适当干燥状态，使辣椒根系生长良好，增强抗病能力。
5科学施肥辣椒生长期长，对土壤的营养条件要求较高。首先要重施基肥，肥料以不带病菌的厩肥、堆肥、腐熟禽粪、草木灰或绿肥等，每亩施用4—5吨。施肥采用畦中挖沟条施，再覆土12厘米左右，辣椒栽在肥沟两旁。肥料与根系应相隔一定距离。当有机肥不足时，可采用复合肥和钾肥，在整畦时均匀撒施。高产地区还采用有机肥配合石灰粉撒施，以杀死土壤中的病菌，改良土壤结构，促进根系发达和植株生长，从而减轻发病。
6及时用药种子出苗后2-3片真叶时，用50%多菌灵800倍液喷1次；定植后至高温雨季来临之前，以预防为主，雨后抢晴用药，重点喷洒地表及植株基部；当田间出现个别病株时，宜采用全园喷洒和个别病株灌根相结合的办法。辣椒疫病在高温高湿季节病菌急速繁殖，当植株长势较弱或遇有伤根外，容易发病。因此，在高温高湿季节应定时用药防治，一般7天左右用药1次，药剂可选用：58%甲霜灵.猛锌可湿性粉剂700倍液；或75%百菌清可湿性粉剂800倍液；或50%甲霜铜可湿性粉剂700倍液；或72.20%普力克水剂700倍液等。
