蔬菜上发生的病害多达几百种，但病原基本上可分为五大类：病毒病害、细菌病害、线虫病害和非侵染性生理病害。
病毒病害：病毒肉眼看不到，靠昆虫传播或接触磨擦传播，几乎所有的蔬菜都可感染病毒病害，蔬菜受侵染后，往往出现维管束系统坏死，主输导组织受害后，全株出现受害症状；支输导组织受害后，局部表现受害症状；微支输导组织受害，形成坏死斑点或斑块。病毒发病症状，没有脓溢、穿孔、破溃等现象，这是田间鉴别病毒的主要依据之一。如番茄病毒病，辣椒、西葫芦病毒病。
细菌病害：一是病变部位有腐烂、斑点、枯萎（维管束病变所致）、溃疡现象，但无明显附着物。另一个特征是发病后期发病部位往往有菌溢出现，可用二块同样大的平玻璃滴上一滴净水，推平，然后用大头针挑取病斑处一点放在水中，静止数秒钟，将两块玻璃合在一起压紧，对光观察，放样处见放射性水弦，这是其它病害所没有的现象。如黄瓜细菌性角斑病，番茄青枯病。
真菌病害：此类病害有病斑且病斑较大，尤其在发病中后期的病斑上病症（包括轮纹、黑色、霉层、粉状物、黑点等）形成十分明显，如黄瓜霜霉病、灰霉病，番茄早、晚疫病，番茄灰霉病，辣椒炭疽病等。
线虫病：可造成地上植物生长不良，地下部分膨大异形，似瘤肿状，或顺上有瘤状种结，如黄瓜、番茄根结线虫病。
生理性病害：首先从整个大田观察，出现的症状是成块成块的发生，而不是像侵染病毒、细菌、真菌、线虫病的发病那样，而是先出现发病中心，再向四周扩散蔓延。
